MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 1667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	CTGG	2	8	103	110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008505	GTTT	2	8	135	142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008505	ATA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008505	ATA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008505	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326548
6	NC_008505	TCTA	2	8	273	280	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
7	NC_008505	CAA	3	9	297	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
8	NC_008505	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
9	NC_008505	CAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
10	NC_008505	AG	3	6	388	393	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
11	NC_008505	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
12	NC_008505	ACT	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326548
13	NC_008505	GA	3	6	452	457	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
14	NC_008505	CTGG	2	8	494	501	0 %	25 %	50 %	25 %	116326548
15	NC_008505	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
16	NC_008505	AGT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
17	NC_008505	ACATT	2	10	621	630	40 %	40 %	0 %	20 %	116326548
18	NC_008505	ATG	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
19	NC_008505	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
20	NC_008505	GAAA	2	8	906	913	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
21	NC_008505	AGG	2	6	937	942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326548
22	NC_008505	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
23	NC_008505	TAA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
24	NC_008505	GAAA	2	8	1120	1127	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
25	NC_008505	AAAGT	2	10	1160	1169	60 %	20 %	20 %	0 %	116326548
26	NC_008505	CATT	2	8	1209	1216	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
27	NC_008505	CTGA	2	8	1280	1287	25 %	25 %	25 %	25 %	116326548
28	NC_008505	AAATGA	2	12	1311	1322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326548
29	NC_008505	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
30	NC_008505	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
31	NC_008505	CAA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
32	NC_008505	ACA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
33	NC_008505	TGA	2	6	1561	1566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
34	NC_008505	ATG	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
35	NC_008505	AATT	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008505	CTA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008505	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008505	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008505	TAA	2	6	1744	1749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008505	CG	3	6	1817	1822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008505	ATC	2	6	1869	1874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008505	TCT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
43	NC_008505	TTG	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
44	NC_008505	AG	3	6	2022	2027	50 %	0 %	50 %	0 %	116326549
45	NC_008505	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
46	NC_008505	GTT	2	6	2072	2077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
47	NC_008505	AAG	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
48	NC_008505	TAA	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
49	NC_008505	TTAT	2	8	2242	2249	25 %	75 %	0 %	0 %	116326549
50	NC_008505	AAT	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
51	NC_008505	ACTT	2	8	2295	2302	25 %	50 %	0 %	25 %	116326549
52	NC_008505	TGT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
53	NC_008505	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
54	NC_008505	CTTT	2	8	2465	2472	0 %	75 %	0 %	25 %	116326549
55	NC_008505	AGA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
56	NC_008505	TTCTT	2	10	2603	2612	0 %	80 %	0 %	20 %	116326549
57	NC_008505	TAG	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008505	GT	3	6	2746	2751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008505	T	7	7	2816	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	116326550
60	NC_008505	TTC	2	6	2834	2839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326550
61	NC_008505	T	6	6	2857	2862	0 %	100 %	0 %	0 %	116326550
62	NC_008505	TAT	2	6	2896	2901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326550
63	NC_008505	AGA	3	9	2948	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326550
64	NC_008505	TCG	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326550
65	NC_008505	AC	3	6	3099	3104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008505	TATAG	2	10	3122	3131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008505	ATT	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008505	CGGAA	2	10	3183	3192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008505	TTAC	2	8	3233	3240	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
70	NC_008505	AAAC	2	8	3256	3263	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
71	NC_008505	AGCA	2	8	3272	3279	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
72	NC_008505	AGA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
73	NC_008505	TGA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
74	NC_008505	GTT	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326551
75	NC_008505	GGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326551
76	NC_008505	AC	3	6	3511	3516	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
77	NC_008505	CAAG	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
78	NC_008505	ATTC	2	8	3551	3558	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
79	NC_008505	AAG	3	9	3589	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
80	NC_008505	ATGA	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	116326551
81	NC_008505	AC	3	6	3710	3715	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
82	NC_008505	GAA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
83	NC_008505	GAA	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
84	NC_008505	CAA	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326551
85	NC_008505	CAAAA	2	10	3887	3896	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
86	NC_008505	A	6	6	3893	3898	100 %	0 %	0 %	0 %	116326551
87	NC_008505	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
88	NC_008505	AACAA	2	10	3955	3964	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
89	NC_008505	AAAC	2	8	4070	4077	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
90	NC_008505	AGA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
91	NC_008505	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326551
92	NC_008505	CAAAAT	2	12	4185	4196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326551
93	NC_008505	ATG	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
94	NC_008505	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
95	NC_008505	ATG	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
96	NC_008505	TA	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008505	T	7	7	4317	4323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008505	GA	3	6	4461	4466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008505	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008505	ATG	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008505	AAAGAA	2	12	4551	4562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008505	AAAGA	2	10	4569	4578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008505	CAT	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008505	A	7	7	4609	4615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008505	TCAA	2	8	4633	4640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008505	T	6	6	4666	4671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008505	A	6	6	4678	4683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008505	ATAA	2	8	4725	4732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008505	TTTA	2	8	4819	4826	25 %	75 %	0 %	0 %	116326552
110	NC_008505	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326552
111	NC_008505	ATT	2	6	5112	5117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326552
112	NC_008505	GTCA	2	8	5374	5381	25 %	25 %	25 %	25 %	116326552
113	NC_008505	GAA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326552
114	NC_008505	T	6	6	5507	5512	0 %	100 %	0 %	0 %	116326552
115	NC_008505	GAT	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326552
116	NC_008505	AAT	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326552
117	NC_008505	TAA	2	6	5710	5715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008505	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008505	TTG	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008505	A	6	6	5913	5918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008505	ATTA	2	8	5924	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008505	GAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008505	ACTTA	2	10	5983	5992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008505	AGG	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008505	TGAAA	2	10	6025	6034	60 %	20 %	20 %	0 %	116326553
126	NC_008505	ATG	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
127	NC_008505	AAG	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326553
128	NC_008505	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
129	NC_008505	TGT	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326553
130	NC_008505	TCA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326553
131	NC_008505	AAAATT	2	12	6517	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326553
132	NC_008505	T	6	6	6592	6597	0 %	100 %	0 %	0 %	116326553
133	NC_008505	GTG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326553
134	NC_008505	TAA	2	6	6628	6633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326554
135	NC_008505	A	6	6	6632	6637	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
136	NC_008505	GAA	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
137	NC_008505	T	7	7	6691	6697	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
138	NC_008505	TAG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
139	NC_008505	T	6	6	6786	6791	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
140	NC_008505	A	7	7	6799	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
141	NC_008505	T	6	6	6815	6820	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
142	NC_008505	GAA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
143	NC_008505	ATT	2	6	6887	6892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326554
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147	NC_008505	AT	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	116326554
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165	NC_008505	A	6	6	8312	8317	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
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183	NC_008505	CAT	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_008505	A	16	16	13247	13262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008505	A	6	6	13277	13282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_008505	ATT	2	6	14351	14356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326560
292	NC_008505	A	6	6	14393	14398	100 %	0 %	0 %	0 %	116326560
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302	NC_008505	AT	4	8	14619	14626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_008505	T	6	6	18454	18459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_008505	AAT	2	6	18506	18511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_008505	ATAA	2	8	18528	18535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_008505	TACA	2	8	18576	18583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
394	NC_008505	TTCAA	2	10	18811	18820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_008505	A	7	7	18869	18875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_008505	AT	4	8	18899	18906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_008505	A	7	7	18932	18938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_008505	GGT	2	6	19238	19243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326563
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403	NC_008505	A	7	7	19403	19409	100 %	0 %	0 %	0 %	116326563
404	NC_008505	GTT	2	6	19412	19417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326563
405	NC_008505	T	7	7	19421	19427	0 %	100 %	0 %	0 %	116326563
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408	NC_008505	AAG	2	6	19462	19467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326563
409	NC_008505	T	6	6	19493	19498	0 %	100 %	0 %	0 %	116326563
410	NC_008505	AAG	2	6	19507	19512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326563
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449	NC_008505	ATAA	2	8	21139	21146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_008505	TAT	2	6	21176	21181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_008505	ATT	2	6	21331	21336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008505	T	6	6	21335	21340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_008505	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_008505	A	6	6	21400	21405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_008505	TA	3	6	21571	21576	50 %	50 %	0 %	0 %	116326565
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480	NC_008505	AAT	2	6	22485	22490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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